（1）臭氧对细菌灭活的机理：臭氧对细菌的灭活反应总是进行地很迅速。与其它杀菌剂不同的是：臭氧能与细菌细胞壁脂类双键反应, 穿入菌体内部，作用于蛋白和脂多糖，改变细胞的通透性，从而导致细菌死亡。臭氧还作用于细胞内的核物质，如核酸中的嘌呤和嘧啶破坏DNA。
（2）臭氧对病毒的灭活机理：臭氧对病毒的作用首先是病毒的衣体壳蛋白的多肽链，并使RNA受到损伤，特别是形成它的蛋白质。噬菌体被臭氧氧化后，其表皮会被破碎成许多碎片，从中释放出许多核糖核酸，干扰其吸附到寄存体上，导致其死亡。
（3）从臭氧的消毒机理和能力来说，应用于污水厂的消毒都是没有什么问题的，使用臭氧消毒的污水厂，同时还可以对出水中的难降解部分的COD可以进一步去除，在一些地区不断提升的出水水质标准下，臭氧也是作为高级氧化的工艺使用在污水厂中的，因此在使用臭氧消毒的污水厂同时也能降解一部分的COD。
（4）但是需要注意的是臭氧在实际污水厂的应用中，操作和管理难度相对较大，也是制约臭氧更广泛应用的阻碍。臭氧极易分解，很难运输和储存，需要在现场进行制备，比较常用的是电晕放电法对纯氧或者含氧干燥空气进行电离，生成臭氧。制备过程较为复杂，需要有制备场所放置臭氧发生器，工业臭氧发生器包括参比电极，绝缘材料，电源系统，循环冷却系统等。
（5）对于污水厂的操作人员来说，这样的精密的工业放电系统，相对于污水厂内其他的设施设备的操作管理难度相对较大，从员工的知识层面上来说还远远不够。
3）臭氧本身是气体，和水中的微生物进行反应，需要和污水进行接触反应，污水厂内一般设置有臭氧接触反应池，采用臭氧鼓泡塔或者扩散器在接触池内和污水接触，在实际运行中臭氧接触时间过短，容易导致臭氧外溢，必须进行外溢的臭氧收集和破坏，避免造成臭氧的逃逸造成操作人员中毒。同时在硬度较高的地区，水中硬度结垢，以及前端处理过程中的悬浮颗粒等对扩散器会造成堵塞。
4）在实际运行中，一定要加强针对臭氧的防护，如果臭氧制备和接触过程中没有做好臭氧的泄露管理，造成污水厂内的臭氧泄露，如果空气中的臭氧浓度超标会有如下危害：
（1）、它强烈刺激人的呼吸道，增多呼吸系统及心血管死亡率，造成咽喉肿痛、胸闷咳嗽、引发支气管炎和肺气肿。
（2）、臭氧会造成人的神经中毒，头晕头痛、视力下降、记忆力衰退。
（3）、臭氧还会破坏人体的免疫机能，尤其是小孩、老人、孕妇等免疫力低下的群体，会诱发淋巴细胞染色体病变，加速衰老，致使孕妇生畸形儿。
（4）、臭氧会对人体皮肤中的维生素E起到破坏作用，致使人的皮肤起皱、出现黑斑。
（5）
（6）、臭氧及有机废气更是一种强致癌物质，会引发各类癌症和心血管疾病。由于臭氧发生过程、臭氧的接触扩散过程都会有臭氧逸出，很容易造成臭氧进入污水厂的操作员工呼吸道内，因此相对于其他消毒方式来说，臭氧消毒的危害的风险性远高于其他种类的消毒方式，这也是臭氧消毒在污水厂中使用的并不是很广泛的重要原因。
5）污水厂深度处理阶段的消毒方式现阶段以这三类为主流工艺，在运行管理中，采用不同的工艺的消毒方式，具体的设备设施的管理内容都不相同，需要结合具体设备的运维操作管理内容制定符合本厂实际的的运行管理操作规程。
6）污水厂的消毒主要的成本在于消毒剂或者照射强度的调整上，而前段处理的效果对消毒影响较大，因此对于成本的管控，需要对前段处理流程进行良好的管控，同时在消毒过程中要定期检测消毒效果，调整合理的加药剂量和强度，污水处理中化学反应的成本控制相对来说控制体系较为简单，污水厂的精细管理也可以从纯化学反应的过程进行开展，逐步向难度较大的生物控制进行。
